Ученый погиб в январе 2010 года, когда рядом с его машиной, припаркованной в центре Тегерана, взорвался заминированный мотоцикл.

Маджид Джамали Фаши признался, что ликвидировал Масуда Али Мохаммади по заданию израильских спецслужб. Он рассказал о своей вербовке агентами из "Моссада" и последующем обучении в Израиле. По словам Фаши, израильтяне обещали ему 50 тысяч долларов за убийство ученого, но выплатили только половину суммы.

За последние несколько лет были убиты по меньшей мере пять иранских ученых-ядерщиков. Похоже, что таким способом США и Израиль пытаются сорвать иранскую ядерную программу.